廣西文蛤(Meretrix)的fAFLP及ITS分析

ANALYSIS OF MERETRIX CLAMS FROM GUANGXI BASED ON FAFLP MARKERS AND ITS SEQUENCES

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摘要：

利用fAFLP標記技術和PCR-RFLP技術,對采集于廣西的形態和殼色變異很大的2個文蛤群體(G、W)以及山東文蛤(S)群體進行了遺傳結構和親緣關系研究.fAFLP分析顯示:在457個總擴增位點中存在53個W群體的特異性位點(其中9個為100%顯性)、21個G群體的特異性位點、14個S群體的特異性位點,這些位點可作為群體鑒別的特征性標記;通過計算群體間相對遺傳距離和聚類分析,發現S和G間的遺傳距離最小(0.0424),在系統樹上首先聚在一起,而W與S、G的相對遺傳距離均很大(0.2308和0.2305),單獨分出一支.對文蛤核糖體ITS的PCR-RFLP結果顯示:W的三個不同殼色類群(WX、WC、WH)的酶切結果完全一致,而與G和S群體差別較大;G和S群體基本一致,但也稍有差別.進一步的ITS序列分析顯示:W的ITS序列長度為1266-1269bp.而G和S分別為1614bp和1520bp;W群體內部序列比較保守,而與G和S群體之間在ITSl和ITS2開始和結尾處均存在多處插入/缺失;在依據序列構建的系統樹上,WX、WC、WH三個類群聚在一起,S和G聚為另一支,兩支相距甚遠.本研究結果表明,fAFLP標記分析、PCR-RFLP分析和ITS序列分析結果一致,W群體和G、S群體的差異較大,已超出種內群體間的遺傳變異,S和G盡管存在遺傳分化,但仍應同屬Meretrix meretrix-個物種.

作者：	林志華[1]黃曉婷[2]董迎輝[3]包振民[2]胡景杰[2]
Author：	LIN Zhi-Hua[1]  HUANG Xiao-Ting[2]  DONG Ying-Hui[3]  BAO Zhen-Min[2]  HU Jing-Jie[2]
作者單位：	浙江萬里學院,寧波,315100;浙江省海洋水產養殖研究所,溫州,325005 中國海洋大學,青島,266003 浙江萬里學院,寧波,315100
期 刊：	海洋與湖沼   ISTICPKU
Journal：	OCEANOLOGIA ET LIMNOLOGIA SINICA
年，卷(期)：	2009, 40(1)
分類號：	S968.3
關鍵詞：	文蛤    fAFLP    ITS    PCR-RFLP    遺傳結構    親緣關系
機標分類號：	S96 S43
機標關鍵詞：	廣西    文蛤群體    ITS分析    BASED    遺傳距離    PCR-RFLP技術    ITS序列分析    位點    特異性    結果    系統樹    親緣關系研究    標記技術    PCR-RFLP分析    遺傳結構    遺傳分化    遺傳變異    序列比較    群體鑒別    類群
基金項目：	國家高技術研究發展計劃(863計劃)，浙江省科技廳重大科技攻關計劃，國家科技基礎條件平臺建設計劃