植物翻譯控制腫瘤蛋白的分子結構特征與功能預測分析

AU Analysis of Molecular Structural Character and Function Prediction on Plant Translationally Controlled Tumor Protein

doi：

摘要：

翻譯控制腫瘤蛋白(The translationally controlled tumor protein,TCTP)是一類廣泛存在于動物、植物及酵母中的,在進化上高度保守、與其它任何蛋白家族均未顯示出明顯的序列同源性的蛋白.采用生物信息學的方法和工具對已在GenBank上注冊的擬南芥(Arabidopsis thaliana)、牽牛(Ipomoea nil)、草莓(Fragaria x ananassa)、橡膠樹(Heveabrasiliensis)、南瓜(Cucurbita maxima)、卷心菜(Brassica oleracea)的翻譯控制腫瘤蛋白的核苷酸及氨基酸序列進行分析,并對其組成成分、轉運肽、跨膜結構域、疏水性/親水性、蛋白質的二級及三級結構、分子系統進化關系等進行預測和分析.結果 表明,該基因的全長包括5'、3'非翻譯區和一個開放讀碼框,其編碼的蛋白是一個無跨膜結構域,不具轉運肽的親水性蛋白,包括一個β-折疊核心區和一個主要的α-螺旋區,不規則卷曲散布于整個蛋白質中,具有TCTP-1和TCTP-2兩個特征結構域.

作者：	陳玉芹王喆之
Author：	Chen Yuqin  Wang Zhezhi
作者單位：	陜西師范大學生命科學學院,西安,710062
期 刊：	生物技術通報   PKU
Journal：	BIOTECHNOLOGY BULLETIN
年，卷(期)：	2008, (2)
分類號：	Q94
關鍵詞：	翻譯控制腫瘤蛋白(TCTP)    分子結構    功能預測    生物信息學
機標分類號：	R38 R73
機標關鍵詞：	植物    翻譯控制腫瘤蛋白    分子結構    特征與功能    結構域    轉運肽    親水性    蛋白質    序列同源性    生物信息學    開放讀碼框    氨基酸序列    組成成分    三級結構    進化關系    分子系統    非翻譯區    蛋白家族    橡膠樹    疏水性
基金項目：