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Cx43基因敲除鼠胚心臟近端流出道組織中Galpha13信號通路基因的差異表達

Differentially Expressed Genes Related with Galpha13 Pathway in the Cardiac Outnow Tract Tissue of Cx43 Knockout Mice

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doi:
摘要:
目的 研究Cx43基因剔除(Cx43 KO)小鼠胚胎心臟近端流出道組織中基因表達譜的改變,篩選可能導致Cx43KO小鼠流出道梗阻的相關基因.方法 以胎齡(embryonic day,ED)14.5天的Cx43KO和野生型(Cx43WT)鼠胚心臟近端流出道部分為研究對象,分別提取總RNA,逆轉錄成cDNA;并在體外轉錄為cRNA,同時進行生物素標記及片段化;再與Affymetrix-430 2.0基因芯片進行雜交.雜交信號經掃描后,應用相關生物信息軟件分析基因表達情況.結果 與Cx43WT組相比,Cx43KO組中表達上調2倍以上的基因共有287個,表達下調2倍以上的基因有199個.其中表達差異的基因參與轉錄調控、細胞周期等主要生理過程.進一步篩查表達差異1.5倍以上的基因發現,Galpha13信號通路上的多個基因在Cx43KO組有明顯變化.結論 利用基因芯片技術初步篩選出與Cx43KO鼠胚心臟近端流出道發育有關的多個基因,其中Galpha13信號通路上的相關基因可能與Cx43KO小鼠流出道梗阻的發生有關.
作者 齊春華[1]黃國英[1]趙曉晴[1]周國民[2]
Author: QI Chun-hua[1]  HUANG Guo-ying[1]  ZHAO Xiao-qing[1]  ZHOU Guo-min[2]
作者單位
  1. 復旦大學附屬兒科醫院心血管中心,上海,200032
  2. 復旦大學上海醫學院解剖與組胚學教研室,上海,200032
期 刊: 中國實驗動物學報   ISTIC
Journal: ACTA LABORATORIUM ANIMALIS SCIENTIA SINICA
年,卷(期) 2007, 15(2)
分類號 R541
關鍵詞: 心臟發育 知識脈絡    Cx43 知識脈絡    Galpha13信號通路 知識脈絡    基因芯片 知識脈絡    小鼠 知識脈絡   
機標分類號 R32 R33
機標關鍵詞 基因敲除    鼠胚    胚胎心臟    流出道    組織    信號通路    相關基因    基因芯片    基因表達譜    表達差異    小鼠    生物素標記    轉錄調控    雜交信號    研究對象    芯片技術    細胞周期    體外轉錄    生物信息    生理過程
基金項目 國家自然科學基金
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