西藏小型豬的線粒體DNA控制區分析

Analysis of Mitochondrial DNA D-Loop Region Sequences in Tibet Mini-Pigs

doi：

摘要：

目的 研究西藏小型豬的遺傳標記以及與其他國內地方豬的親緣關系.方法 擴增102 頭西藏小型豬以及16 頭巴馬小型豬、17 頭貴州香豬的線粒體DNA控制區,測序并與國內其他豬進行比較.結果 西藏小型豬線粒體DNA D-loop區分三個區域.串聯重復序列區處于中間位置,包含有15～29 個10 bp的重復片段,分為A、B 兩種類型.D-loop 3′端340 bp,與國內其他豬的序列相同比較保守;5′端704 bp,共有22個變異位點.由22 個變異位點中歸納出25 個單倍型,其中有兩種主要的單倍型,分別占34.4%和36.6%.根據三個轉換位點:305、500、691,將西藏小型豬分成了兩組,幾乎與串聯重復序列所分的A、B兩組類型相對應.與西藏小型豬相比,巴馬小型豬和貴州香豬D-loop 5′端變異位點較少,分別只有4 種和2 種單倍型,串聯重復區也只有一個類型.結論 西藏小型豬可能有兩個母系祖先并且與我國西南地區的品種豬有較近的親緣關系;不同的串聯重復片段類型和5′ 端的變異位點可以聯合組建西藏小型豬的遺傳標記.

作者：	李洪濤[1]吳清洪[2]肖東[2]袁進[2]王萬山[2]張嘉寧[2]李金澤[2]張建明[2]顧為望[2]
Author：	LI Hong-tao[1]  WU Qing-hong[2]  XIAO Dong[2]  YUAN Jin[2]  WANG Wan-shan[2]  ZHANG Jia-ning[2]  LI Jin-ze[2]  ZHANG Jian-ming[2]  GU Wei-wang[2]
作者單位：	呼吸疾病國家重點實驗室(廣州醫學院),廣州,510230 南方醫科大學實驗動物中心,廣州,510515
期 刊：	中國實驗動物學報   ISTIC
Journal：	ACTA LABORATORIUM ANIMALIS SCIENTIA SINICA
年，卷(期)：	2009, 17(3)
分類號：	R332
關鍵詞：	西藏小型豬    線粒體DNA控制區    遺傳標記
機標分類號：	S85 X87
機標關鍵詞：	西藏小型豬    線粒體    DNA D-Loop    控制區    分析    Region    串聯重復序列    變異位點    巴馬小型豬    單倍型    D-loop    重復片段    遺傳標記    親緣關系    貴州香豬    中間位置    西南地區    品種豬    段類型    地方豬
基金項目：	廣東省科研計劃項目