近交系小鼠雙色熒光正相雜交芯片技術體系的建立和優化

Establishment and Optimization of Dual-Color Fluorescence and Positive Hybridization Chip Technique System in the Inbred Mouse Strains

doi：

摘要：

目的 探討采用單核苷酸多態性(SNP)檢測方法-雙色熒光正相雜交芯片技術對近交系小鼠遺傳質量監測及相關影響因素.方法 運用基于芯片的雙色熒光正相雜交檢測SNP技術,進行芯片雜交動力學研究,考察信號值(Cy3,Cy5)和ratio值(Cy5/Cy3)與PCR產物點樣濃度、PCB產物長度和熒光標記探針長度之間的關系,研究PCR產物點樣濃度、PCR產物長度和熒光標記探針長度對SNP分型的影響.結果 采用正反標記實驗后,Ratio值隨著PCR產物點樣濃度的增加呈穩定趨勢;PCR雙鏈產物長度對信號值影響比較大,點樣時其長度不宜太長,最好不超過450 bp;隨熒光標記探針長度的增加,基因分型能力明顯下降,長度為15 bp最佳,長度超過20 bp時,已基本沒有區分能力.結論 PCR產物點樣濃度、PCR產物長度和熒光標記探針長度是雙色熒光正相雜交SNP分型系統的重要影響因素,采取適當的PCR產物點樣濃度、PCR產物長度和熒光標記探針長度,并采用正反標記實驗,可以取得穩定、準確的基因分型效果.為進一步進行近交系小鼠遺傳質量監測的研究奠定基礎.

作者：	瞿秀華[1]闞廣捍[2]余琛琳[1]湯球[1]孫偉[1]崔淑芳[1]
Author：	QU Xiu-hua[1]  KAN Guang-han[2]  YU Chen-lin[1]  TANG Qiu[1]  SUN Wei[1]  CUI Shu-fang[1]
作者單位：	第二軍醫大學實驗動物中心,上海,200433 中國航天員科研訓練中心,北京,100094
期 刊：	中國比較醫學雜志   ISTIC
Journal：	CHINESE JOURNAL OF COMPARATIVE MEDICINE
年，卷(期)：	2008, 18(10)
分類號：	R-33
關鍵詞：	單核苷酸多態性    芯片    雙色熒光雜交    小鼠
機標分類號：	R59 Q95
機標關鍵詞：	近交系小鼠遺傳質量監測    雙色熒光    雜交檢測    芯片雜交    技術體系    熒光標記探針    長度    濃度    相關影響因素    基因分型    標記實驗    單核苷酸多態性    動力學研究    影響比較    信號    芯片技術    能力    檢測方法    實驗后    運用
基金項目：	上海市科技發展基金